Rừng ngập mặn Cần Giờ phát triển dựa trên sự lắng đọng và bồi tụ của phù sa đưa từ sông Sài Gòn - Đồng Nai mà đến hạ lưu là sông Lòng Tàu và sông Ngã Bảy, sông Đồng Tranh - sông Nhà Bè và sông Soài Rạp.

Môi trường của Rừng ngập mặn Cần Giờ có điều kiện rất đặc biệt. là một hệ sinh thái trung gian (hệ đệm) giữa hệ sinh thái thủy vực với hệ sinh thái trên cạn, hệ sinh thái nước ngọt và hệ sinh thái nước mặn. Là một vùng ven biển có nhiều cửa sông, Rừng ngập mặn Cần Giờ nhận một lượng lớn phù sa và chất dinh dưỡng từ thượng nguồn và lưu vực của các con sông và dưới sự ảnh hưởng của biển - thủy triều đã hình thành hệ thực vật rừng Sác phong phú về các chủng loại và là nơi cung cấp thức ăn nuôi dưỡng, là nơi cư trú của các loài thủy sinh vật và động vật có xương sống ở cạn.

Riêng rừng ngập mặn Vàm Sát có một hệ thống động thực vật phong phú và đa dạng như: đước, dừa nước, tràm, bần, sú, vẹt; 63 loài vi sinh vật, 140 loài động vật đáy như tôm, cua, sò ốc, 45 loài cá, 8 loài bò sát, 37 loài chim và một số loài thú như khỉ, hươu, nai, chồn. Nơi đây còn có một số loài vật quý hiếm được ghi trong Sách đỏ như cá sấu hoa cà, bồ nông chân xám, rái cá lông mượt